История биатлона в автономном округе началась в 1970-х годах.
В 1974 году Валерий Захаров организует первую секцию биатлона при городском совете ДСО «Спартак» в Ханты-Мансийске. Через четыре года появился первый мастер спорта по биатлону. Им стал Юрий Коллегов.
В 1980 году Сергей Данч, воспитанник тренера Николая Петровича Бондарева, в составе сборной команды СССР по биатлону станет участником зимних Олимпийских игр в Лейк-Плесиде, а позже завоюет серебряную медаль на чемпионате мира среди юниоров.
В 1982 году еще один воспитанник Н. П. Бондарева, Юрий Кашкаров, становится чемпионом мира среди юниоров, а с 1983 по 1991 годы – неоднократным победителем и призером чемпионатов мира среди мужчин.
24 августа 1982 г. в Ханты-Мансийске решением президиума Тюменского областного совета профсоюзов при городском совете ДСО «Спартак» была открыта первая в Тюменской области детско-юношеская спортивная школа (ДЮСШ) по биатлону с соответствующей материально-технической базой, куда входило:
- здание школы с оружейной комнатой
- здание общежития на 100 мест
- здание столовой на 50 посадочных мест
- биатлонное стрельбище на 25 биатлонных установок
- гараж на 4 бокса
- здание отопительной котельной
- водонапорная башня с двумя скважинами
- здание восстановительного центра
- лыжные трассы – 2; 3; 5 км
Первым директором школы был назначен Александр Иванович Власов.
В 1984 году Юрий Кашкаров – олимпийский чемпион в Сараево.
В 1992 году в Альбервиле олимпийское золото на дистанции 20 км завоевал Евгений Редькин, который закончил Ханты-Мансийскую ДЮСШ по лыжным гонкам у заслуженного тренера СССР Владимира Ивановича Куклина. В том же году Евгений Редькин стал чемпионом мира.
В 1992 году, с согласия главы администрации ХМАО Филипенко А. В., спортивная школа была передана в комитет по физической культуре и спорту ХМАО, и стала окружной.
Вся материально-техническая база школы была передана в ХМАО безвозмездно.
С 1992 по 1997 гг. в школе было открыто 7 филиалов в городах и районах ХМАО: г. Нижневартовск, г. Урай, п. Междуреченский Кондинского района, г. Нефтеюганск, г. Нягань, Сургутский район и п. Березово.
В 1993 году по поручению Губернатора округа А. В. Филипенко разрабатывается «Программа развития биатлона в Ханты-Мансийском автономном округе», основными элементами которой являются: укрепление материальной базы, создание системы подготовки спортсменов, привлечение как можно больше детей к занятиям биатлоном.
В Ханты-Мансийском автономном округе формируется своя концепция развития биатлона. Открывается окружная школа высшего спортивного мастерства. Создается сборная команда округа, которая самостоятельно представляет свою территорию на Всероссийских соревнованиях.
С 1994 года в составы сборной команды страны по биатлону входят члены сборной команды Ханты-Мансийского автономного округа, которые защищают цвета национального флага на международной арене. Еще одной важной вехой в истории развития биатлона в округе явилась состоявшаяся в октябре 1995 года рабочая встреча Исполкома Международного Союза биатлонистов, Союза биатлонистов России и администрации Ханты-Мансийского автономного округа. На этой встрече обсуждались вопросы дальнейшего развития биатлона в округе, строительство современного центра лыжного спорта. В этом же году администрацией ХМАО было принято решение о строительстве нового спортивного комплекса на территории старого. В 1996 г. старый комплекс был снесен, и началось строительство нового биатлонного комплекса Международного значения.
В 1996 г. школа получила статус – Школа олимпийского резерва (СДЮСШОР).
В 1997 году здесь впервые прошли международные соревнования по биатлону «Кубок Югры» (коммерческие старты).
В декабре 2000 года были сданы: стадион, огневой рубеж, трибуны, способные вместить более 10 000 зрителей, здание спортивной школы, лыже-роллерная трасса, мосты и путепровод, здание спортивного клуба, гостиничный комплекс.
В 2002 году закончено строительство современного здания пресс-центра и новых командных комнат.
К чемпионату мира 2003 было построено здание пресс-центра Центра лыжного спорта, в котором к услугам журналистов имеется 2 зала на 200 рабочих мест и ISDN-подключений, помещение для пресс-конференций с системой синхронного перевода. На стадионе расположены 22 комментаторские кабины.
С 1 июля 2005 г. решением окружного Комитета по физической культуре и спорта все филиалы школы были переданы в муниципальные образования.
В августе 2007 года СДЮСШОР исполняется 25 лет. Все перспективные учащиеся школы после 18-летнего возраста передаются для своего дальнейшего спортивного совершенствования в Центр спортивной подготовки сборных команд Югры.
В 2003 году Ханты-Мансийск впервые в истории России принял Чемпионат мира по биатлону; в 2011 году Ханты-Мансийск вновь принимал чемпионат мира по биатлону, в 2012, 2013, 2015, 2016 годах – этапы Кубка мира.
C сентября 2009 году началась новая реконструкция, предусматривающая установку новой трибуны, реконструкцию комментаторских кабинок, перенос линии старта. На сегодняшний день демонтированы старые комментаторские кабины, северная и VIP-трибуна, возведена новая трибуна, под которой располагаются офисные и технические помещения: комната международных судей, офис соревнований, комната IBU и др. Над трибуной разместились комментаторские кабины. Расширили зоны старта и финиша. На месте прежних комментаторских кабин располагается разворотная эстакада. Подземный туннель дает возможность доступа в зоны СМИ на стрельбище и в финишную зону.
С 1994 года (год официального создания сборной команды ХМАО по биатлону) десятки спортсменов – членов сборной команды Ханты-Мансийского автономного округа многократно становились победителями и призерами чемпионатов и первенств России, Всероссийских и международных соревнований.
С 1999 года биатлонный центр Ханты-Мансийска принимает у себя финальный этап Кубка мира по биатлону.
2 декабря 2010 года, в преддверии 80-летия ХМАО-Югры, Правительство Югры присвоило Центру лыжного спорта имя Александра Васильевича Филипенко.